157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0745 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  71.28 
 
 		 188 aa  280  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 205 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 205 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 205 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  39.66 
 
 		 215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  32.48 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.48 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  32.48 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  26.14 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  25.95 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  27.64 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  24.68 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  29.66 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  26.24 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.92 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  29 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  23.62 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>