160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0635 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  96.05 
 
 
152 aa  296  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  96.05 
 
 
152 aa  296  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  88.82 
 
 
152 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  41.27 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  39.26 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  38.76 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  36.22 
 
 
137 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.65 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.65 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  35.38 
 
 
138 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  31.78 
 
 
143 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.29 
 
 
144 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  38.54 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  35.66 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  37.21 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  34.45 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.35 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.59 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  36.43 
 
 
319 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.31 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  41.11 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  36.92 
 
 
312 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  31.54 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  36.89 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  30.23 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  38.13 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  35.11 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  29.46 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  30.89 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.06 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  41.96 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  35.33 
 
 
550 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  35.33 
 
 
550 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.42 
 
 
550 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.4 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.9 
 
 
311 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  32.48 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.52 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.47 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  43.42 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.2 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  31.67 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  34.15 
 
 
322 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  31.67 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  32.84 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  29.55 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  29.55 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  29.55 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.27 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  29.03 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  29.84 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  35.42 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  30.66 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  34.78 
 
 
548 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  29.93 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  33.08 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  27.45 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  30.08 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  27.45 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  35.16 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  30.39 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30.47 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  37.36 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  32.26 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  24.62 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.29 
 
 
548 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  30.93 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  30.08 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  24.62 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  23.85 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  26.19 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  26.4 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  35.16 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  35.16 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  36.96 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  29.21 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  29.27 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  36.71 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  34.94 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  35.29 
 
 
311 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  54.3  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  29.9 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>