More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0527 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  97.2 
 
 		 393 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.49 
 
 		 393 aa  778    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 393 aa  781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.49 
 
 		 393 aa  778    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.49 
 
 		 393 aa  778    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.49 
 
 		 393 aa  778    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.05 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  50 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.66 
 
 		 400 aa  302  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  50.93 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  49.74 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  41.64 
 
 		 396 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  41.16 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  40.82 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  37.21 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  37.83 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  36.83 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.16 
 
 		 397 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  36.39 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 		 272 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  46.77 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 390 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.16 
 
 		 161 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.64 
 
 		 154 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  44.44 
 
 		 251 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 		 128 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 		 128 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 		 128 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 		 128 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 		 260 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.34 
 
 		 128 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 128 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.34 
 
 		 128 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.84 
 
 		 128 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 		 128 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.34 
 
 		 261 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 		 129 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 		 129 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 		 128 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.2 
 
 		 129 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 		 128 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.66 
 
 		 128 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.11 
 
 		 132 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 		 132 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.47 
 
 		 131 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  57.38 
 
 		 130 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.83 
 
 		 128 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.68 
 
 		 132 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  57.48 
 
 		 131 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  42.62 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  39.26 
 
 		 263 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  54.24 
 
 		 133 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  38.03 
 
 		 256 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  38.03 
 
 		 256 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  38.03 
 
 		 256 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.54 
 
 		 134 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 		 129 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  34.85 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  52.54 
 
 		 133 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 130 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.89 
 
 		 130 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 130 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.31 
 
 		 130 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.45 
 
 		 132 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.84 
 
 		 133 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.93 
 
 		 137 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  35.87 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 132 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.1 
 
 		 133 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  49.59 
 
 		 132 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.04 
 
 		 130 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 		 132 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  36.36 
 
 		 256 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  30.61 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  35.24 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2282  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.36 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175309  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  36.18 
 
 		 262 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  35.24 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 		 135 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 		 122 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 263 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 		 138 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 125 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.39 
 
 		 134 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 		 138 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.51 
 
 		 140 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  42.62 
 
 		 129 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.37 
 
 		 143 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.74 
 
 		 133 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>