94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0489 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  76.47 
 
 
273 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  60.36 
 
 
297 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  60.36 
 
 
279 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  59.64 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  36.84 
 
 
332 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  36.45 
 
 
329 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  37.81 
 
 
330 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  36.79 
 
 
330 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  36.79 
 
 
330 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  36.79 
 
 
330 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  36.33 
 
 
330 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  36.33 
 
 
330 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  36.33 
 
 
330 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  36.91 
 
 
318 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  32.21 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  30.7 
 
 
327 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  31.65 
 
 
344 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  31.91 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  43.9 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  43.9 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  43.9 
 
 
342 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  43.9 
 
 
335 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  45.95 
 
 
325 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  41.43 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  41.43 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  41.43 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  31.51 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  48 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.19 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  31.63 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  31.21 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  40.31 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  39.83 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  42.62 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  42.62 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  30.62 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  28.14 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  42.62 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  30.29 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  32.01 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  28.85 
 
 
331 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  36.62 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  40 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  28.35 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  38.46 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  37.25 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  30 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  27.9 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  23.27 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  39.32 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  29.3 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  32.77 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  38.4 
 
 
335 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  27.51 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  39.32 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  26.85 
 
 
392 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  33.8 
 
 
367 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  37.61 
 
 
343 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  27.24 
 
 
335 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  33.33 
 
 
1006 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  21.34 
 
 
377 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  27.61 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.61 
 
 
684 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  31.93 
 
 
968 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  20.7 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  41.54 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  35.97 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  28.79 
 
 
351 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  24.63 
 
 
330 aa  49.3  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  24.69 
 
 
375 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  35.14 
 
 
324 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  24.11 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  42.19 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  36.75 
 
 
336 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  35.61 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  23.51 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  35.61 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  36.36 
 
 
375 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  31.67 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  23.9 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  32.89 
 
 
672 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  32.48 
 
 
989 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  27.39 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  34.92 
 
 
372 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  23.78 
 
 
339 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1049  hypothetical protein  46.88 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>