27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0468 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1017    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  38.94 
 
 
565 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  33.02 
 
 
526 aa  117  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  34.35 
 
 
486 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  36.89 
 
 
506 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  38.98 
 
 
508 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  40.5 
 
 
504 aa  80.1  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  33.66 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  40.33 
 
 
494 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  31.09 
 
 
567 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  26.47 
 
 
618 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  33.33 
 
 
523 aa  67.4  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  26.52 
 
 
536 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  34.06 
 
 
478 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  28.23 
 
 
726 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  20.22 
 
 
531 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  24.44 
 
 
543 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  27.94 
 
 
704 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  26.29 
 
 
492 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  32.54 
 
 
729 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  22.77 
 
 
658 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  32.32 
 
 
531 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  23.38 
 
 
618 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
513 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  31.3 
 
 
727 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  32.74 
 
 
544 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>