28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0459 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  100 
 
 
129 aa  245  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  72.18 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  70 
 
 
127 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  70 
 
 
127 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  70 
 
 
127 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  68.07 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  53.27 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  52.25 
 
 
118 aa  100  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  48.62 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  52.43 
 
 
124 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  39.68 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  40.54 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  41.03 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  48.03 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  42.74 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  39.53 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  38.52 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  38.18 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  51.04 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  43.93 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  38 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  36.84 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  39.39 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  34.75 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  35.45 
 
 
144 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>