136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0381 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  80.58 
 
 
246 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  72.94 
 
 
231 aa  285  6e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  72.94 
 
 
231 aa  285  6e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  72.94 
 
 
231 aa  283  1e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  58.85 
 
 
247 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  54.39 
 
 
238 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  51.13 
 
 
244 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.78 
 
 
230 aa  179  3e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  4.57043e-07 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  50.46 
 
 
228 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.08 
 
 
252 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  6.19723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  42.6 
 
 
250 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1776  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.84 
 
 
245 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.324205  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.57 
 
 
248 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.53 
 
 
531 aa  120  1e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.18 
 
 
515 aa  118  8e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.62 
 
 
307 aa  118  8e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  36.95 
 
 
255 aa  115  9e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.6 
 
 
238 aa  114  2e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.77 
 
 
246 aa  113  4e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00880  hypothetical protein  40.78 
 
 
251 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.04 
 
 
289 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.14 
 
 
253 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28310  hypothetical protein  40.17 
 
 
306 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1812  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46.53 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.54 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  33.77 
 
 
281 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.62 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.5 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1324  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.21 
 
 
275 aa  88.6  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215746  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.58 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2430  hypothetical protein  32.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.32 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.8 
 
 
234 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09950  hypothetical protein  37.34 
 
 
249 aa  84.3  2e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.14 
 
 
234 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3702  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.75 
 
 
238 aa  84  2e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.512385  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.14 
 
 
234 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.96 
 
 
410 aa  83.2  4e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.74 
 
 
234 aa  82.8  5e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  25.91 
 
 
251 aa  81.3  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.62 
 
 
253 aa  81.6  1e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  26.36 
 
 
251 aa  81.3  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  26.36 
 
 
251 aa  81.3  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  35.74 
 
 
259 aa  81.3  2e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.5 
 
 
250 aa  80.1  3e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  26.7 
 
 
251 aa  80.5  3e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  25.91 
 
 
251 aa  80.1  3e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  25.91 
 
 
251 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  25.56 
 
 
251 aa  79.7  4e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.2 
 
 
408 aa  79.7  5e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.51 
 
 
247 aa  78.6  9e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.47 
 
 
248 aa  75.9  7e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.92 
 
 
410 aa  75.1  1e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  25.73 
 
 
250 aa  74.3  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  7.56549e-06 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.26 
 
 
238 aa  74.3  2e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  26.13 
 
 
236 aa  72  9e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  25.63 
 
 
236 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  25.63 
 
 
236 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.13 
 
 
236 aa  70.9  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  25 
 
 
251 aa  71.2  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  26.13 
 
 
236 aa  71.2  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.17 
 
 
250 aa  70.9  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  25.63 
 
 
236 aa  69.7  4e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0297  hypothetical protein  31.03 
 
 
225 aa  69.7  4e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.625672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.25 
 
 
258 aa  69.7  4e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.12 
 
 
297 aa  69.3  5e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  26.13 
 
 
236 aa  69.7  5e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.55 
 
 
550 aa  69.3  6e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.21 
 
 
553 aa  68.9  8e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.58 
 
 
250 aa  68.6  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.15 
 
 
520 aa  67.4  2e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.41 
 
 
357 aa  67  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  24.62 
 
 
236 aa  65.9  7e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  24.62 
 
 
236 aa  65.5  7e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.24 
 
 
304 aa  65.5  9e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5164  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.69 
 
 
301 aa  62  1e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.89 
 
 
247 aa  61.6  1e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.51 
 
 
275 aa  61.6  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.51 
 
 
288 aa  62  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.98 
 
 
465 aa  60.5  3e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  21.67 
 
 
400 aa  60.1  4e-08  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.63 
 
 
347 aa  59.7  4e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  26.53 
 
 
534 aa  58.2  1e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.13 
 
 
258 aa  58.5  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  25.65 
 
 
349 aa  58.2  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  20.91 
 
 
379 aa  57  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  23.83 
 
 
416 aa  56.2  4e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  23.04 
 
 
375 aa  55.8  7e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.67 
 
 
326 aa  55.5  8e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  20.91 
 
 
401 aa  54.7  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.4 
 
 
277 aa  54.3  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.33242e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 
309 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.86 
 
 
248 aa  53.5  3e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.73 
 
 
333 aa  52.4  7e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  24.06 
 
 
275 aa  52.4  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.73 
 
 
330 aa  52.4  7e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  24.78 
 
 
337 aa  52  9e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.54 
 
 
241 aa  52  1e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  24.78 
 
 
337 aa  51.6  1e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>