112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0380 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.34 
 
 
382 aa  651  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  100 
 
 
380 aa  743  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.34 
 
 
382 aa  651  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  93.95 
 
 
380 aa  678  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.6 
 
 
382 aa  654  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  70.13 
 
 
381 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.22 
 
 
377 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  56.8 
 
 
378 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.64 
 
 
391 aa  356  3e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  5.62153e-06 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.81 
 
 
390 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.87789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.68 
 
 
362 aa  331  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.95 
 
 
362 aa  327  2e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.19 
 
 
381 aa  327  2e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  1.57223e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.39 
 
 
383 aa  327  2e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  52.94 
 
 
383 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.16 
 
 
368 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.72 
 
 
376 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  48.95 
 
 
389 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.3 
 
 
391 aa  283  4e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.01 
 
 
381 aa  262  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  47.59 
 
 
372 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  42.9 
 
 
377 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  47.27 
 
 
387 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.99 
 
 
394 aa  253  4e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  46.22 
 
 
369 aa  244  2e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.89 
 
 
387 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.47 
 
 
419 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.32035e-05  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.95 
 
 
387 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92794e-08 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.97 
 
 
372 aa  217  3e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  42.29 
 
 
435 aa  201  2e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  32.95 
 
 
264 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.93 
 
 
281 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  28.35 
 
 
266 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  6.0174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.85 
 
 
284 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.56 
 
 
261 aa  90.1  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.69 
 
 
291 aa  84.7  2e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.96 
 
 
271 aa  82.4  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.45 
 
 
269 aa  80.9  3e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.48 
 
 
269 aa  78.6  2e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.52 
 
 
284 aa  74.7  3e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.41 
 
 
511 aa  72.8  8e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  26.46 
 
 
277 aa  67.4  4e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.8 
 
 
281 aa  66.2  9e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.68 
 
 
503 aa  63.2  7e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.77 
 
 
280 aa  62.4  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.12 
 
 
277 aa  61.2  3e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.52 
 
 
281 aa  60.8  4e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.44 
 
 
503 aa  59.7  8e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.39 
 
 
503 aa  59.3  1e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  29.76 
 
 
513 aa  58.5  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.74 
 
 
507 aa  57.4  4e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  27.07 
 
 
276 aa  55.1  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.90734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.22 
 
 
513 aa  55.1  2e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.31 
 
 
491 aa  53.1  7e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27 
 
 
502 aa  52.4  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.35 
 
 
513 aa  52.4  1e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.31 
 
 
519 aa  51.2  3e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.88 
 
 
281 aa  50.8  4e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25 
 
 
267 aa  50.4  5e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.7 
 
 
505 aa  49.7  9e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  26.48 
 
 
272 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.78 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  25.3 
 
 
266 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 
237 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 
227 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.57 
 
 
579 aa  46.2  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1420  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 
234 aa  46.2  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.08 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 
231 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1663  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650844  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14691  two-component response regulator  42.11 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.132919  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  25.51 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
245 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 
226 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.42937e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.7 
 
 
234 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.541096  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.27 
 
 
511 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.65328e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.00566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12191  two-component response regulator  40.79 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1124  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.747385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.22084e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.56124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12201  two-component response regulator  40.79 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  21.39 
 
 
231 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  4.30064e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  21.39 
 
 
231 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.09 
 
 
510 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 
251 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12041  two-component response regulator  39.47 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  32.93 
 
 
1080 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1693  two component transcriptional regulator  37.35 
 
 
229 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000234642 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0637  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
254 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.27696e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  36.71 
 
 
225 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  1.12462e-08 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  41.89 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.14 
 
 
242 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>