96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0356 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  64.04 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  60.23 
 
 		 523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  43.97 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  38.15 
 
 		 534 aa  276  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 535 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  37.57 
 
 		 536 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  38.08 
 
 		 566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  38.07 
 
 		 547 aa  230  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.43 
 
 		 596 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 		 536 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  36.16 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  37.94 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  30.34 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.47 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  37.08 
 
 		 557 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  35.63 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  18.98 
 
 		 537 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.8 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.83 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  30.19 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  30.41 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.95 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.52 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  18.87 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.34 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  24.13 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  30.08 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.29 
 
 		 519 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  30.91 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  16.67 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  30.32 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  38.76 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  24.55 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.3 
 
 		 445 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  24.21 
 
 		 518 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  26.16 
 
 		 483 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 383 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  26.11 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  24.63 
 
 		 538 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.32 
 
 		 739 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.6 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25.53 
 
 		 512 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.11 
 
 		 665 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  21.47 
 
 		 740 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  25.09 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.48 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  26.89 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  30.85 
 
 		 487 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  31.31 
 
 		 616 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 312 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.87 
 
 		 410 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  25.87 
 
 		 410 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.06 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.14 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  22.36 
 
 		 602 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.57 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.13 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  29.57 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  25.45 
 
 		 535 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.95 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.57 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  25.35 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  25.35 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  25.95 
 
 		 611 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.35 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 429 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 429 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 429 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  27.21 
 
 		 618 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  30.89 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 365 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  24.15 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  26.26 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 405 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 531 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>