More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0346 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  83.44 
 
 
471 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  83.44 
 
 
471 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
470 aa  892    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  83.44 
 
 
471 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  88.51 
 
 
470 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.3 
 
 
521 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.77 
 
 
498 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.29 
 
 
491 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.88 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  53.93 
 
 
488 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.86 
 
 
479 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.67 
 
 
506 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.97 
 
 
491 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.08 
 
 
481 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 
480 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.79 
 
 
507 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.39 
 
 
515 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.79 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  52 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  49.48 
 
 
494 aa  415  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.71 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.27 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.2 
 
 
517 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.47 
 
 
461 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.72 
 
 
475 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  48.77 
 
 
484 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.56 
 
 
463 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  46.03 
 
 
493 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.86 
 
 
488 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.74 
 
 
483 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.68 
 
 
518 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  51.06 
 
 
496 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  46.58 
 
 
502 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.73 
 
 
484 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.81 
 
 
480 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.89 
 
 
465 aa  319  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  44.37 
 
 
456 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.96 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.08 
 
 
496 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.29 
 
 
456 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.07 
 
 
456 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.38 
 
 
460 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 
466 aa  279  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.54 
 
 
463 aa  279  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.93 
 
 
460 aa  276  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.34 
 
 
442 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.81 
 
 
429 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.45 
 
 
441 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.88 
 
 
437 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.79 
 
 
440 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.72 
 
 
433 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  36.66 
 
 
430 aa  260  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  36.46 
 
 
436 aa  259  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  36.74 
 
 
429 aa  259  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.01 
 
 
441 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  36.34 
 
 
429 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.72 
 
 
429 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 
462 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.37 
 
 
429 aa  256  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.36 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.2 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.23 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  36.23 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  36.23 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  35.08 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  34.85 
 
 
444 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.66 
 
 
433 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.28 
 
 
429 aa  253  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.88 
 
 
454 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.72 
 
 
429 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.51 
 
 
445 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.44 
 
 
433 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.94 
 
 
431 aa  252  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.95 
 
 
457 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.71 
 
 
430 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 
432 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.01 
 
 
433 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.45 
 
 
471 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.28 
 
 
429 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.98 
 
 
431 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  35.59 
 
 
430 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.65 
 
 
441 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.91 
 
 
465 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.45 
 
 
453 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.27 
 
 
445 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  36.98 
 
 
431 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.5 
 
 
429 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  36.81 
 
 
445 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  35.31 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.36 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.7 
 
 
433 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  36.59 
 
 
445 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  36.59 
 
 
445 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 
428 aa  246  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.5 
 
 
429 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.5 
 
 
429 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.5 
 
 
429 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.59 
 
 
445 aa  246  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.64 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  35.22 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>