More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0341 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  91.02 
 
 
564 aa  1058    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  75.35 
 
 
560 aa  880    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  77.84 
 
 
574 aa  889    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
569 aa  1149    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  77.66 
 
 
577 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  77.66 
 
 
577 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 
542 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 
532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  44.62 
 
 
539 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.61 
 
 
541 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  45.11 
 
 
548 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  45.11 
 
 
548 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  45.11 
 
 
548 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  43.3 
 
 
527 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  43.9 
 
 
535 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  42.56 
 
 
535 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
539 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  42.23 
 
 
540 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  40.87 
 
 
550 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  41.3 
 
 
541 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  43.2 
 
 
530 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.95 
 
 
545 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 
544 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  42.15 
 
 
544 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  42.08 
 
 
544 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
534 aa  363  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
560 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 
550 aa  359  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  40.73 
 
 
531 aa  349  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
546 aa  349  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 
562 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
518 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 
516 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
511 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 
510 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  32.27 
 
 
487 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.04 
 
 
543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 
527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.47 
 
 
492 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 
532 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.29 
 
 
514 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.47 
 
 
503 aa  230  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
524 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.49 
 
 
497 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.49 
 
 
497 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
509 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
501 aa  223  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
512 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 
512 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  30.62 
 
 
500 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.11 
 
 
525 aa  220  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 
517 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.45 
 
 
516 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  29.96 
 
 
500 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  31.65 
 
 
511 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 
499 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 
514 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.6 
 
 
549 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
508 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
511 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
552 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
521 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 
512 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 
516 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
516 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 
500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.26 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.66 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
517 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
516 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.53 
 
 
500 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  29.56 
 
 
500 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
517 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
500 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.79 
 
 
552 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 
518 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.12 
 
 
514 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 
516 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  29.8 
 
 
499 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 
512 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  27.96 
 
 
596 aa  210  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 
515 aa  210  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  30.97 
 
 
516 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  31.57 
 
 
536 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.74 
 
 
552 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  29.47 
 
 
500 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.16 
 
 
549 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  29.47 
 
 
500 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  31.25 
 
 
515 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  31.25 
 
 
515 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
518 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.75 
 
 
552 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.27 
 
 
490 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.98 
 
 
513 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
520 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>