24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0300 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  100 
 
 
407 aa  819    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  67.49 
 
 
413 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  67.49 
 
 
413 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  41.5 
 
 
418 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  40.74 
 
 
437 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  40.1 
 
 
399 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  37.93 
 
 
414 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  39.16 
 
 
399 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  38.93 
 
 
378 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  32.77 
 
 
423 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  37.06 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  32.16 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  38.26 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  30.87 
 
 
474 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  29.56 
 
 
387 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  34.06 
 
 
304 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  29.48 
 
 
488 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  29.24 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  31.6 
 
 
495 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  31.58 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  26.8 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.33 
 
 
1411 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  40 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.8 
 
 
254 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>