More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0288 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  100 
 
 
444 aa  885  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  8.66708e-05  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  76.47 
 
 
447 aa  657  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  87.02 
 
 
443 aa  770  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  76.47 
 
 
447 aa  659  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  76.47 
 
 
447 aa  659  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  66.97 
 
 
438 aa  587  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  46.73 
 
 
464 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  47.81 
 
 
435 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  44.68 
 
 
431 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  43.94 
 
 
450 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.8 
 
 
405 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  39.56 
 
 
430 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.52 
 
 
409 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  36.92 
 
 
420 aa  221  1e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.12 
 
 
410 aa  222  1e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.61 
 
 
411 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.2 
 
 
410 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35 
 
 
409 aa  219  9e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.61 
 
 
411 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.61 
 
 
411 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.62 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.61 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08493e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  37.31 
 
 
411 aa  216  6e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  37.31 
 
 
411 aa  216  6e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.6 
 
 
417 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.1 
 
 
407 aa  215  1e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.7 
 
 
417 aa  215  1e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  2.07738e-07  decreased coverage  9.04548e-07 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.1 
 
 
407 aa  215  1e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.1 
 
 
407 aa  215  1e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.23 
 
 
412 aa  215  2e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  215  2e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.99 
 
 
412 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.95 
 
 
426 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.69 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40 
 
 
402 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.98 
 
 
405 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.76 
 
 
423 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  39.52 
 
 
418 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  39.94 
 
 
390 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  40.71 
 
 
429 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.05 
 
 
401 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.05 
 
 
402 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  42.72 
 
 
400 aa  201  2e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.54 
 
 
416 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.52 
 
 
411 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.32 
 
 
404 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.5 
 
 
399 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.36 
 
 
400 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.62 
 
 
411 aa  199  1e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  42.9 
 
 
421 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40.36 
 
 
414 aa  197  4e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.06 
 
 
394 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  35.09 
 
 
406 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  37.38 
 
 
421 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.58 
 
 
410 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.93 
 
 
412 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.49 
 
 
391 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6383  cytochrome P450-like protein  47.22 
 
 
379 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  37.39 
 
 
405 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  34.98 
 
 
419 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.68 
 
 
411 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.34 
 
 
412 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  32.99 
 
 
415 aa  191  3e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.09 
 
 
398 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.84 
 
 
412 aa  189  6e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  36.09 
 
 
409 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.82 
 
 
411 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.2 
 
 
417 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.75 
 
 
402 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  35.62 
 
 
402 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.47 
 
 
419 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.7 
 
 
420 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.25 
 
 
423 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  34.8 
 
 
417 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.54 
 
 
398 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  36.2 
 
 
367 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.9 
 
 
408 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.2 
 
 
398 aa  184  2e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.09 
 
 
407 aa  185  2e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.15 
 
 
405 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.06 
 
 
401 aa  184  4e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.6 
 
 
417 aa  184  4e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.07 
 
 
398 aa  183  5e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  38.2 
 
 
409 aa  182  9e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.94 
 
 
406 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.48 
 
 
388 aa  181  3e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.87 
 
 
395 aa  181  3e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32 
 
 
406 aa  181  3e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  37.78 
 
 
418 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  40.12 
 
 
427 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  33.75 
 
 
430 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  34.5 
 
 
405 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.9 
 
 
402 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  33.25 
 
 
393 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  35.69 
 
 
404 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.88 
 
 
414 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.93 
 
 
399 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  35.64 
 
 
404 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  34.37 
 
 
407 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>