38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0287 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  491  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  4.1503e-05  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  72.58 
 
 
248 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  68.4 
 
 
249 aa  341  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  68 
 
 
249 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  68 
 
 
249 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  58.57 
 
 
261 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  51.21 
 
 
246 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  37.23 
 
 
272 aa  140  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  37.45 
 
 
262 aa  129  5e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  33.48 
 
 
255 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  33.89 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  30.9 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  31.85 
 
 
241 aa  83.2  4e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  30.59 
 
 
249 aa  79  6e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  33.49 
 
 
253 aa  77.8  1e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  32.38 
 
 
253 aa  75.5  7e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  38.96 
 
 
246 aa  71.6  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  30.82 
 
 
257 aa  71.2  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  27.84 
 
 
250 aa  68.9  8e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  30.08 
 
 
252 aa  66.2  5e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  28.85 
 
 
257 aa  65.1  9e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  30.18 
 
 
254 aa  63.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  32 
 
 
247 aa  63.9  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  29.9 
 
 
238 aa  62.8  5e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  33.58 
 
 
241 aa  61.6  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  28.19 
 
 
266 aa  60.8  2e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  35.77 
 
 
260 aa  60.1  3e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  28.82 
 
 
266 aa  57.8  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  57.4  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  29.17 
 
 
283 aa  55.8  7e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  29.45 
 
 
254 aa  55.1  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  27.88 
 
 
269 aa  53.1  4e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  26.9 
 
 
292 aa  52  1e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  29.56 
 
 
202 aa  50.1  4e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  31.51 
 
 
234 aa  49.7  5e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  25.44 
 
 
261 aa  49.3  6e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  30.95 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>