173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0189 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  78.33 
 
 
488 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  100 
 
 
488 aa  976    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  66.45 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  66.45 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  66.67 
 
 
479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  46.98 
 
 
501 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  46.77 
 
 
501 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  46.77 
 
 
501 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  46.67 
 
 
500 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  47.84 
 
 
510 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  48.37 
 
 
502 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  45.38 
 
 
513 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  44.3 
 
 
512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  45.32 
 
 
506 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  43.18 
 
 
509 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  38.36 
 
 
512 aa  266  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  39.21 
 
 
524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  38.13 
 
 
481 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  35.87 
 
 
536 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  35.67 
 
 
535 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  35.91 
 
 
512 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  36.5 
 
 
512 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  37.37 
 
 
548 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  35.02 
 
 
512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  36.34 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  35.4 
 
 
514 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.09 
 
 
518 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  34.26 
 
 
534 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  34.83 
 
 
555 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  33.68 
 
 
503 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  48 
 
 
502 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  48.25 
 
 
518 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  48.26 
 
 
519 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  30.75 
 
 
533 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  31.57 
 
 
502 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  42.86 
 
 
312 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.15 
 
 
1077 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  41.59 
 
 
437 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.41 
 
 
1147 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  42.2 
 
 
947 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  40.43 
 
 
313 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  38.6 
 
 
1131 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  37.28 
 
 
309 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  35.81 
 
 
291 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.99 
 
 
391 aa  93.2  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.27 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.33 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  27.33 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  26.02 
 
 
465 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.98 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  32.08 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  26.24 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  26.24 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.24 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  27.13 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  26.24 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  26.52 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  26.52 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  26.02 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  31.6 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  31.25 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  24.88 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  28.19 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  31.74 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  30.21 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  32.2 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  25.75 
 
 
472 aa  67  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  31.74 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  31.28 
 
 
339 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  43.48 
 
 
539 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.81 
 
 
584 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  26.09 
 
 
481 aa  65.1  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.57 
 
 
333 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  27.92 
 
 
454 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  29.43 
 
 
469 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  22.82 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  30.59 
 
 
571 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.74 
 
 
944 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  38.53 
 
 
775 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  29.77 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  29.45 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  43.75 
 
 
525 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.48 
 
 
440 aa  60.1  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  28.62 
 
 
477 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  27.57 
 
 
1247 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  28.28 
 
 
468 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  30.23 
 
 
471 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  23.51 
 
 
487 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  31.71 
 
 
625 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  24.14 
 
 
799 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  28.52 
 
 
308 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.39 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  27.13 
 
 
457 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  25.51 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  37.25 
 
 
647 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  34.26 
 
 
578 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  37.25 
 
 
647 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  33.97 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  25.42 
 
 
574 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  32.43 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>