More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0175 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  92.39 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  82.23 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  82.74 
 
 		 197 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  82.74 
 
 		 197 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  82.74 
 
 		 197 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  69.19 
 
 		 200 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  64.97 
 
 		 198 aa  260  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  61.93 
 
 		 190 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  64.36 
 
 		 183 aa  248  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  63.08 
 
 		 195 aa  245  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  54.31 
 
 		 190 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  52.79 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  54.75 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  47.55 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  43.65 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  53.33 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.37 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  50.61 
 
 		 182 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  48.09 
 
 		 168 aa  140  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  49.72 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.11 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  47.4 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  48.57 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  51.85 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  47.37 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  43.33 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  47.75 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  46.07 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  40.82 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  45.2 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.51 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  50 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  49.72 
 
 		 178 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  43.33 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.48 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  44.63 
 
 		 162 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  48.78 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  45.4 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  43.33 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  39.5 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  41.81 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  45.68 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.67 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  40.84 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.33 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  39.11 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  40.11 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  44.13 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  47.77 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  42.26 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  43.9 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.34 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  42.78 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  38.55 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  40.33 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  39.71 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  38.25 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  41.34 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  41.34 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.83 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  41.57 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  37.43 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.33 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.27 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  37.65 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  37.99 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  36.78 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  36.78 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  36.31 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  39.41 
 
 		 173 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  35.58 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  34.55 
 
 		 154 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  34.25 
 
 		 168 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.78 
 
 		 174 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  37.04 
 
 		 150 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  35.96 
 
 		 168 aa  95.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  34.83 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  34.25 
 
 		 168 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.2 
 
 		 171 aa  94.7  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40 
 
 		 173 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  33.7 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  34.78 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  36.81 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  35.4 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  39.02 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  34.64 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  38.89 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  35.96 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  34.64 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  36.11 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  36.84 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  36.52 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.2 
 
 		 171 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  36.52 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  35 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  35 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  36.21 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  35.15 
 
 		 163 aa  91.3  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>