More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0148 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  533  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  84.82 
 
 		 268 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  47.58 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  49.8 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  46.8 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  46 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  45.6 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  45.75 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  44.98 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  45.38 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  45.88 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  43.72 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  40.23 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  37.9 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  36.29 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  31.58 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.02 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  32.8 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  32.8 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  32.8 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  32.8 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.8 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  32.4 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  32.4 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  32.4 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  32.8 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.19 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.46 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.13 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  28.97 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  31.97 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  32.32 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.13 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  38.06 
 
 		 429 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 377 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  29.22 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.82 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  28.75 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  24.73 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  40.96 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 648 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  42.06 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  32.45 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  39.76 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 63 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  31.69 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  41.67 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 133 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  28.11 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  30.84 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>