More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0094 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
382 aa  781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  95.53 
 
 
385 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  60.27 
 
 
416 aa  465  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  61.19 
 
 
396 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  61.02 
 
 
396 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  58.4 
 
 
401 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  37.03 
 
 
340 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  38.18 
 
 
345 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  38.18 
 
 
345 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  38.18 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  36.86 
 
 
321 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  38.21 
 
 
378 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  35.83 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  38.57 
 
 
333 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  35.9 
 
 
317 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  34.36 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  36.36 
 
 
354 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  32.19 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  33.44 
 
 
319 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  33.44 
 
 
319 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  33.44 
 
 
319 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  35.5 
 
 
365 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  34.56 
 
 
320 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  32.28 
 
 
346 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  35.5 
 
 
365 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  35.5 
 
 
365 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  35.62 
 
 
356 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  34.67 
 
 
317 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  31.09 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  34.56 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  32.59 
 
 
315 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  35.08 
 
 
321 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0990  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.99 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  36.08 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  36.08 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  36.08 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  32.37 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  33.12 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  34.27 
 
 
316 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  32.8 
 
 
315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  33.33 
 
 
323 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  35.92 
 
 
351 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  34 
 
 
329 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.67 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  35.55 
 
 
318 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  32.69 
 
 
337 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  33.44 
 
 
324 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  32.67 
 
 
319 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  33.66 
 
 
310 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  34.21 
 
 
316 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.52 
 
 
334 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  33.88 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  32.05 
 
 
321 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  34.3 
 
 
324 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  32.91 
 
 
324 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.21 
 
 
319 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  37.99 
 
 
352 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  33.65 
 
 
316 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  35.39 
 
 
351 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  32.56 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  33.56 
 
 
315 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  32.56 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  32.89 
 
 
315 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  32.8 
 
 
322 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  32.56 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  35.06 
 
 
351 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  34.94 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  35.69 
 
 
346 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  32.59 
 
 
354 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  34 
 
 
318 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  33.88 
 
 
322 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  32.14 
 
 
324 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  33.33 
 
 
334 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  33.02 
 
 
320 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  33.02 
 
 
320 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  33.02 
 
 
320 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  34.68 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  33.45 
 
 
287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  33.55 
 
 
315 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  32.38 
 
 
310 aa  153  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  33 
 
 
316 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  33.44 
 
 
324 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  30.5 
 
 
378 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  34.69 
 
 
309 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.7 
 
 
335 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  33.55 
 
 
316 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  32.34 
 
 
304 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  32.18 
 
 
329 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  33.89 
 
 
319 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  31.56 
 
 
291 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  33.77 
 
 
317 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  33.77 
 
 
322 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  31.43 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  33.77 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  31.43 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  32.11 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  31.16 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  30.57 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  30.79 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  34.11 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>