More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0093 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  100 
 
 		 505 aa  993    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  77.6 
 
 		 505 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  77.6 
 
 		 505 aa  725    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  77.6 
 
 		 505 aa  725    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  88.05 
 
 		 507 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  40.53 
 
 		 741 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.76 
 
 		 482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  28.27 
 
 		 449 aa  133  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  29.62 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  28.44 
 
 		 483 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 482 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  29.22 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  27.65 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.81 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.87 
 
 		 507 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  27.43 
 
 		 479 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  26 
 
 		 475 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 478 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.45 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.19 
 
 		 526 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.83 
 
 		 463 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.79 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  25 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  27.76 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.29 
 
 		 523 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.68 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.81 
 
 		 486 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.88 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.59 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.47 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 		 613 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  27.13 
 
 		 497 aa  87  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.34 
 
 		 506 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  24.27 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.61 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  24.17 
 
 		 495 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.05 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.86 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.11 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25.21 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  28.44 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.18 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.15 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.82 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.32 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.38 
 
 		 551 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.49 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.58 
 
 		 567 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.78 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  23.63 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.51 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.55 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25.52 
 
 		 460 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  23.94 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.69 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  30.17 
 
 		 564 aa  70.5  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.17 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.54 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.05 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  25.32 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.59 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  29.57 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  23.78 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.61 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  24.93 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.69 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  24.11 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  24.18 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  24.18 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  24.18 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 492 aa  67  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.9 
 
 		 548 aa  67  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  22.62 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  24.28 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  23.5 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  25.42 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.05 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>