More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0075 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  80.95 
 
 
294 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  80.95 
 
 
294 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  80.95 
 
 
294 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0837  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.76 
 
 
306 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10509  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.86 
 
 
295 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.4 
 
 
270 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.1 
 
 
270 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.62 
 
 
276 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.54 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.84 
 
 
267 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.91 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.33 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.06 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.42 
 
 
264 aa  212  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.42 
 
 
264 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.47 
 
 
276 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  45.2 
 
 
264 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.81 
 
 
297 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.66 
 
 
270 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.3 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.99 
 
 
272 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.2 
 
 
271 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.99 
 
 
272 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
279 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.06 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.85 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.66 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.78 
 
 
268 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.46 
 
 
272 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.31 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.24 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.65 
 
 
269 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 
267 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.14 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.43 
 
 
273 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.66 
 
 
271 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 
276 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.79 
 
 
267 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
274 aa  178  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
272 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.79 
 
 
545 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.21 
 
 
270 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.86 
 
 
271 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.14 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.61 
 
 
281 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.11 
 
 
274 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.7 
 
 
274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.35 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.52 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.35 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.85 
 
 
272 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.41 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.75 
 
 
270 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
280 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
285 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 
279 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.77 
 
 
272 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
277 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.81 
 
 
276 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
273 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.32 
 
 
275 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.56 
 
 
275 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
267 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.01 
 
 
262 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
277 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
272 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.69 
 
 
257 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.54 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  36.79 
 
 
289 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.11 
 
 
272 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.72 
 
 
272 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  37.72 
 
 
276 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.28 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.49 
 
 
314 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.54 
 
 
274 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.72 
 
 
272 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 
273 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.37 
 
 
272 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.27 
 
 
269 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.37 
 
 
273 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.72 
 
 
272 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.31 
 
 
278 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.1 
 
 
272 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.39 
 
 
276 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.39 
 
 
272 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.39 
 
 
276 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.51 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.38 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.87 
 
 
272 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.38 
 
 
280 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.75 
 
 
272 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.87 
 
 
272 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>