More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0064 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
326 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  88.34 
 
 
326 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.69 
 
 
323 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.69 
 
 
323 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.69 
 
 
323 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.7 
 
 
329 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  73.07 
 
 
325 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.28 
 
 
323 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.69 
 
 
327 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  67.18 
 
 
330 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 
324 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  64.62 
 
 
323 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  66.04 
 
 
340 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.3 
 
 
333 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  63.98 
 
 
340 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.8 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.77 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  63.08 
 
 
328 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.99 
 
 
326 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.27 
 
 
329 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  61.42 
 
 
335 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  61.04 
 
 
328 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  63.14 
 
 
330 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  65.23 
 
 
329 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.46 
 
 
327 aa  381  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.13 
 
 
336 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 
327 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  57.43 
 
 
351 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  63.89 
 
 
329 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  60.3 
 
 
344 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 
328 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  62.18 
 
 
332 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  61.23 
 
 
328 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.55 
 
 
338 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  61.06 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  57.23 
 
 
325 aa  350  2e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 
340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.47 
 
 
347 aa  334  1e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.61 
 
 
326 aa  329  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.68 
 
 
326 aa  328  6e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 
326 aa  326  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.53 
 
 
325 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.15 
 
 
336 aa  323  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 
336 aa  323  3e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 
326 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.4 
 
 
327 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.19 
 
 
338 aa  322  7e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
330 aa  319  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
330 aa  319  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  50.15 
 
 
336 aa  318  9e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.8 
 
 
352 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
324 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.59 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  51.23 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.73 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.29 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.99 
 
 
328 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.99 
 
 
328 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.39 
 
 
325 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.16 
 
 
337 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
325 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
324 aa  309  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.4 
 
 
327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.47 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.68 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
338 aa  305  6e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.88 
 
 
341 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.18 
 
 
324 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.4 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.07 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.55 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  49.54 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.14 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.34 
 
 
322 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.93 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.48 
 
 
324 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
318 aa  301  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.48 
 
 
324 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  50.93 
 
 
325 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.32 
 
 
339 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.65 
 
 
322 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.48 
 
 
323 aa  299  5e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.54 
 
 
343 aa  298  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
327 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.65 
 
 
322 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45 
 
 
321 aa  298  9e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  47.2 
 
 
403 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.69 
 
 
326 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.69 
 
 
321 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.51 
 
 
327 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  47.53 
 
 
328 aa  296  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.48 
 
 
325 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.96 
 
 
335 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 
327 aa  295  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.79 
 
 
336 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.49 
 
 
317 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>