132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0060 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  90.48 
 
 
309 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  75.51 
 
 
303 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  75.51 
 
 
303 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  75.85 
 
 
303 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  57.78 
 
 
304 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  44.94 
 
 
312 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10841  hypothetical protein  38.06 
 
 
351 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.27324e-31  hitchhiker  0.00000189365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  37.6 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4509  hypothetical protein  36.79 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4596  hypothetical protein  36.79 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4892  hypothetical protein  36.79 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  38.02 
 
 
364 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1670  hypothetical protein  37.11 
 
 
339 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5083  hypothetical protein  36.8 
 
 
339 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  36.95 
 
 
351 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  31.53 
 
 
351 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  32.17 
 
 
351 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  32.17 
 
 
351 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  32.99 
 
 
355 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  32.42 
 
 
340 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  31.07 
 
 
294 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0043  Protein of unknown function DUF2236  31.47 
 
 
263 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  30.83 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1533  Protein of unknown function DUF2236  30.43 
 
 
223 aa  89  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  28.94 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  29.72 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  29.29 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  30.65 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  28.68 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  31.07 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  28.51 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  30.47 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  28.88 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  27.7 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  26.2 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  26.2 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  26.2 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  33.72 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  33.16 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  27.81 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  30.32 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  30.6 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  30.46 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  29.92 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  31.22 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  30.15 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  27.78 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  29.06 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  30.3 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  29.65 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  28.2 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  26.91 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  30.3 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  32.5 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  29.92 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3134  Protein of unknown function DUF2236  26.34 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  30.35 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  27.35 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  28.63 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  31.28 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  28.63 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  26.92 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  26.92 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  28.63 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  26.15 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  31.32 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  28.63 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  28.63 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  28.63 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  28.63 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  28.74 
 
 
289 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  29.38 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  27.27 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  29.44 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  23.19 
 
 
342 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  26.5 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  28.17 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  26.5 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  25.2 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  25.2 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  25.2 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  31.18 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  30.28 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  27.41 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  27.41 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  24.27 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  25.97 
 
 
298 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  28.04 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  30.17 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  26.9 
 
 
377 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  25.7 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  24.55 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  27.57 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0434  hypothetical protein  27.68 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>