285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0040 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  77.27 
 
 
286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  64.01 
 
 
289 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  64.01 
 
 
289 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  64.01 
 
 
289 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  43.23 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  44.27 
 
 
297 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  37.26 
 
 
299 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  37.7 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  37.45 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  34.55 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  30.95 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 
309 aa  89  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.63 
 
 
295 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.72 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.6 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.41 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  30.77 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.74 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  24.82 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  31.94 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.1 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  24.5 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.95 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  27.66 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.68 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  23.9 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  29.59 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  28 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  23.77 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  32.31 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  23.53 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  23.9 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  26.35 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.13 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  24 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  29.65 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.89 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30.46 
 
 
440 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  30.81 
 
 
430 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  24.2 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.04 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  27.93 
 
 
428 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.25 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  30.85 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  28 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  31.53 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  31.67 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  27.88 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  27.33 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.98 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  40.45 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  20.6 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.75 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.5 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  25.43 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.78 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  27.15 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  44.16 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  23.44 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.48 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  19.72 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  26.98 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.27 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  29.77 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  24.4 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  30.29 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  33.57 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  48.48 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  46.97 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  45.45 
 
 
449 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  45.45 
 
 
449 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  27.6 
 
 
312 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  45.45 
 
 
449 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  31.71 
 
 
431 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  35.58 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.15 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  46.97 
 
 
441 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  26.96 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  39 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  30.94 
 
 
432 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.81 
 
 
436 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  20.77 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  27.85 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  55.77 
 
 
473 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 
444 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  26.56 
 
 
433 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>