More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0037 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  93.62 
 
 
376 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
378 aa  762    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.09 
 
 
374 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.09 
 
 
374 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  78.55 
 
 
374 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.4 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.98 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  56.4 
 
 
383 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.3 
 
 
377 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  49.47 
 
 
370 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.6 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.49 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  50.55 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  44.41 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  50 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.83 
 
 
376 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.83 
 
 
376 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.83 
 
 
376 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.21 
 
 
376 aa  291  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.3 
 
 
377 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.95 
 
 
373 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.95 
 
 
373 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.89 
 
 
373 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.69 
 
 
373 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.5 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.95 
 
 
378 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.63 
 
 
373 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.32 
 
 
373 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.36 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.74 
 
 
367 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.05 
 
 
371 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.42 
 
 
372 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.16 
 
 
380 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.73 
 
 
377 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.93 
 
 
360 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.5 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  30.48 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.33 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.05 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.93 
 
 
315 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.42 
 
 
317 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.23 
 
 
331 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  28.61 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.59 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.59 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.93 
 
 
326 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.53 
 
 
315 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.32 
 
 
316 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.85 
 
 
355 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.85 
 
 
355 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.18 
 
 
364 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  27.55 
 
 
364 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  27.9 
 
 
365 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.9 
 
 
364 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.5 
 
 
363 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  28.99 
 
 
364 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.61 
 
 
378 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  24.86 
 
 
321 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  28.61 
 
 
363 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.33 
 
 
309 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.49 
 
 
316 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  28.13 
 
 
355 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  27.07 
 
 
364 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  27.07 
 
 
364 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.51 
 
 
326 aa  101  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.81 
 
 
334 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.12 
 
 
356 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.86 
 
 
325 aa  99.4  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.12 
 
 
360 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.14 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  27.51 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.49 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.98 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.05 
 
 
363 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.86 
 
 
319 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.35 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.64 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.43 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.54 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.98 
 
 
342 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.73 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.16 
 
 
350 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.82 
 
 
323 aa  89  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.17 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.97 
 
 
317 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  37.06 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.86 
 
 
329 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.63 
 
 
314 aa  87  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.96 
 
 
323 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.71 
 
 
345 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.81 
 
 
341 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.83 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.76 
 
 
324 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.42 
 
 
314 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.33 
 
 
319 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.68 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.52 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  28.11 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>