284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0023 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  81.28 
 
 
235 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  74.34 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  74.34 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  74.34 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  59.91 
 
 
228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.66 
 
 
230 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.02 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  49.55 
 
 
203 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.56 
 
 
232 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  44.67 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  46.27 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  42 
 
 
209 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.33 
 
 
219 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  29.77 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.87 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  38.33 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  39.8 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.74 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.89 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.66 
 
 
234 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.38 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.82 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.62 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.59 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  39.81 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  39.81 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  34.34 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  38.83 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  33.6 
 
 
218 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  32.81 
 
 
245 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.53 
 
 
200 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  29.19 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  41.75 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.83 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  40.59 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.69 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.97 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  29 
 
 
214 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  41.49 
 
 
229 aa  52  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.68 
 
 
235 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  37 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  37 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  37.7 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  32.2 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.38 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.58 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  27.06 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  32.98 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  29.08 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.58 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1676  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.87 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.73 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.73 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  43.59 
 
 
133 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5896  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.98 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.04 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  26.96 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.19 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.19 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.19 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.19 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.19 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.36 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  24.23 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
292 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.58 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  43.42 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  36 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.78 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.58 
 
 
246 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.34 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  37.65 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  37.36 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.22 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  32.63 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.1 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.96 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
225 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  27.05 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  32.56 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  34.96 
 
 
243 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.11 
 
 
217 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>