142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0020 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  100 
 
 
255 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  42.72 
 
 
277 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  42.56 
 
 
252 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  43.11 
 
 
252 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  43.72 
 
 
260 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  39.75 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  42.44 
 
 
427 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  41.1 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  39.3 
 
 
464 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  39.47 
 
 
462 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  40.08 
 
 
251 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  40.08 
 
 
251 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  35.36 
 
 
502 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  39.35 
 
 
250 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  39.55 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  28.75 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  32.41 
 
 
253 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  36.03 
 
 
708 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  35 
 
 
464 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  37.91 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  34.31 
 
 
471 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  40.94 
 
 
234 aa  85.5  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  35.29 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  33.94 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  36.05 
 
 
447 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  35.81 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  34.9 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  32.96 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  34.23 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  27.97 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  26.84 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  33.57 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.31 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  29.09 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  34.19 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  28.35 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  32.88 
 
 
304 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  33.56 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  27.16 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.18 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  28.81 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.92 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  31.85 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.13 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  32.83 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  30.34 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  33.59 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.76 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.23 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  27.89 
 
 
277 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  29.84 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  31.85 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  26.98 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  31.76 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  29.31 
 
 
299 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  32.37 
 
 
250 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  35.37 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  29.69 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  30.51 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  33.97 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  30.6 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.87 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  32.58 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.87 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.87 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.87 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.87 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.87 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  29.66 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  31.62 
 
 
239 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  32.26 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.66 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  29.11 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.68 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  31.4 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  25.95 
 
 
221 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  28.18 
 
 
274 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  28.81 
 
 
234 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.46 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  28.81 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.33 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  39.02 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  27.69 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  27.07 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  32.26 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  28.57 
 
 
309 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  27.06 
 
 
469 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  29.93 
 
 
288 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  27.07 
 
 
220 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  31.82 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  27.07 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  27.07 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  23.68 
 
 
237 aa  45.4  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  27.07 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  29.6 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.56 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  23.96 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>