52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0004 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0004  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0965  hypothetical protein  62.79 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1660  hypothetical protein  30.24 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.401371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1633  hypothetical protein  30.24 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.575862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1684  hypothetical protein  30.24 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  27.85 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11394  hypothetical protein  28.47 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0519  hypothetical protein  27.85 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  25.14 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  29.87 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2527  hypothetical protein  25.46 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689022  normal  0.570985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3667  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939543  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11393  hypothetical protein  27.33 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4164  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2526  hypothetical protein  28.66 
 
 
295 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0275  hypothetical protein  34.36 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274335  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3726  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3653  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.367228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4132  hypothetical protein  26.57 
 
 
300 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3654  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0983187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0294  hypothetical protein  34.36 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0284  hypothetical protein  34.36 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3727  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  27.01 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  27.17 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1498  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2554  hypothetical protein  28.83 
 
 
447 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00704002  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3666  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.58266  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  23.57 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  29.44 
 
 
200 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  29.2 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1174  hypothetical protein  24.86 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.147447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3132  hypothetical protein  30.06 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4340  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4339  hypothetical protein  22.06 
 
 
325 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4163  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4529  hypothetical protein  27.62 
 
 
179 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0852137  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1078  hypothetical protein  26.02 
 
 
171 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.941653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1554  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1531  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1563  hypothetical protein  26.09 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0710  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.3 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4994  hypothetical protein  30.7 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1077  hypothetical protein  26.61 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4131  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 
227 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.500094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3017  hypothetical protein  25.16 
 
 
276 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>