More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt05 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  94.52 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  94.52 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  94.52 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  95.45 
 
 
73 bp  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  95.45 
 
 
78 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  93.15 
 
 
79 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0404  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.96 
 
 
79 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.96 
 
 
79 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.96 
 
 
79 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.96 
 
 
79 bp  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.96 
 
 
79 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.96 
 
 
79 bp  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  95.16 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  95.16 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.16 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  95.16 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  95.16 
 
 
73 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  95.16 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  95.16 
 
 
73 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  95.16 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt014  tRNA-Thr  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0018476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  90.41 
 
 
155 bp  89.7  9e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  90.14 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  96 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  97.78 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151608  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  97.78 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  97.78 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  95.92 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  97.78 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  97.78 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  97.78 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>