299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0042 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  98.48 
 
 		 85 bp  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3504  tRNA-Leu  93.67 
 
 		 85 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41320  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 82 bp  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73657  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  92.41 
 
 		 85 bp  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  92.41 
 
 		 85 bp  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  95.52 
 
 		 85 bp  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60230  tRNA-Leu  94.03 
 
 		 82 bp  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  92.75 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 84 bp  97.6  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  90.12 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 84 bp  89.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t52  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329875  normal  0.0339044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0057  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811413  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0065  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.401468  normal  0.0428865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0042  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  86.08 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0025  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>