224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0014 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  91.04 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  91.04 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0050  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  84.88 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t05  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA69  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00000487503  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0010  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.29414e-23  normal  0.0775658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0018  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0069  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0060  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00028228  normal  0.398472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0046  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60020  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t045  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t047  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R89  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0013  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000242624  normal  0.0244003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0095  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000654361  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0096  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00070521  normal  0.980641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0097  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186117  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0013  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000911406  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0093  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00406786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0094  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000412805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0095  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000439573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0067  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.439921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0068  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0069  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0013  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000166479  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0092  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0093  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000411147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0094  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.926918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0073  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.92183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>