87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2710 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  45.83 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4866  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894538  normal  0.194277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3025  DNA-binding protein, putative  38.46 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.74 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1764  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  37.37 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2310  XRE family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000103087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2626  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.36 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0766  Cro/CI family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.047378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0797  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000538753  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3742  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0314  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000214612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3047  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.44 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2898  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.64 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.294834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3181  transcriptional regulator, putative  46.88 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0405  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000114125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2905  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0131008  normal  0.248064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4463  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  32.71 
 
 		 321 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  34.74 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  43.75 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  33.33 
 
 		 240 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  39.34 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 140 aa  43.5  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  34.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  32.18 
 
 		 240 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  57.5 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  34.78 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  29.49 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  29.49 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2265  hypothetical protein  41.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2477  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229914  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  35.05 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  35.48 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 144 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 229 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3923  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.680179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1242  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.471276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  30.85 
 
 		 388 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.07 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  32.61 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3602  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1400  hypothetical protein  28.44 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1717  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.123728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4415  helix-turn-helix DNA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1700  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  40.38 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 380 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 123 aa  40  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  40 
 
 		 230 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>