More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2676 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  59.38 
 
 
265 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  56.18 
 
 
261 aa  279  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  56.98 
 
 
259 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  57.6 
 
 
259 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  57.26 
 
 
265 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  56.4 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  58.66 
 
 
260 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  56.4 
 
 
259 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  56 
 
 
259 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  54.9 
 
 
254 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  55.6 
 
 
257 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  56.8 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  56.8 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  56.8 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  56.4 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  56.4 
 
 
257 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  57.6 
 
 
257 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0134  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 
266 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0284  short chain dehydrogenase  54.79 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0142  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 
266 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 
258 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  46.4 
 
 
266 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
260 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  45.7 
 
 
260 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 
270 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 
261 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  43.85 
 
 
267 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
270 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  44.86 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  44.86 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
242 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
249 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  38.01 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
265 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
259 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
277 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
261 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0372396  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
246 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  29.22 
 
 
239 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
250 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
254 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0637  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.08 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
250 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
251 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
251 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
250 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 
251 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
250 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
250 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
238 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
269 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
275 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1339  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.66 
 
 
261 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.789963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
245 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0379321  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1087  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  31.56 
 
 
245 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
266 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
272 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
253 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 
265 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 
267 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
267 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 
276 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
267 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
256 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
258 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
249 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>