More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2673 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 
568 aa  698    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
561 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
593 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
596 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  63.26 
 
 
564 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 
577 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
595 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 
557 aa  722    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
593 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
567 aa  657    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
561 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
569 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
596 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 
561 aa  700    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
562 aa  664    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
594 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
598 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
596 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 
565 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
556 aa  1144    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
561 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
596 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 
562 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 
561 aa  729    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
602 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
562 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
593 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
565 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
561 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
593 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
593 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
593 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 
562 aa  689    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 
563 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
594 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
594 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 
561 aa  738    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
569 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 
558 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 
600 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
569 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
575 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1977  arginyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
575 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
598 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
587 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
587 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
589 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
589 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
586 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
556 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
563 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
584 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
587 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
611 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
557 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
570 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
553 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
592 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
586 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
551 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
554 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
561 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
550 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
586 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
553 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
592 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
553 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
588 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
559 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
575 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
550 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
561 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
559 aa  433  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
559 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
553 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
550 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>