More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2672 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  50.47 
 
 
734 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  100 
 
 
738 aa  1507    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0113  primosome assembly protein PriA  48.87 
 
 
757 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373406  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3889  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 
748 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2943  primosome assembly protein PriA  48.08 
 
 
753 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0112  primosome assembly protein PriA  48.08 
 
 
753 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3303  primosome assembly protein PriA  49.14 
 
 
764 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  47.52 
 
 
765 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3961  primosome assembly protein PriA  48.55 
 
 
755 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0111  primosome assembly protein PriA  48.01 
 
 
753 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0102  primosome assembly protein PriA  48.01 
 
 
753 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0127  primosome assembly protein PriA  47.68 
 
 
753 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3348  primosome assembly protein PriA  48.55 
 
 
755 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2963  primosome assembly protein PriA  48.55 
 
 
755 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1579  primosome assembly protein PriA  48.55 
 
 
755 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0169  primosome assembly protein PriA  48.62 
 
 
755 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3293  primosome assembly protein PriA  48.28 
 
 
753 aa  611  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259169  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3023  primosome assembly protein PriA  48.55 
 
 
755 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  46.85 
 
 
765 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4035  primosome assembly protein PriA  48.55 
 
 
755 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0045  primosome assembly protein PriA  47.27 
 
 
747 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.493665  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3022  primosome assembly protein PriA  48.27 
 
 
752 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  44.5 
 
 
733 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 
733 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  45.28 
 
 
734 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  46.72 
 
 
768 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2781  replication restart DNA helicase PriA  46.45 
 
 
719 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0033  replication restart DNA helicase PriA  54.28 
 
 
666 aa  582  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.101123  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  43.45 
 
 
733 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3341  primosome assembly protein PriA  45.53 
 
 
761 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000327838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  45.38 
 
 
739 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  45.15 
 
 
724 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  45.24 
 
 
739 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  45.38 
 
 
739 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  45.05 
 
 
739 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  42.7 
 
 
736 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3490  primosome assembly protein PriA  45 
 
 
764 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000105942  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  45.39 
 
 
743 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  44.35 
 
 
731 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  44.93 
 
 
732 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  44.93 
 
 
732 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  45 
 
 
732 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  44.93 
 
 
732 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  43.01 
 
 
739 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  44.76 
 
 
740 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  44.52 
 
 
744 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 
732 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 
732 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 
732 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  46.18 
 
 
738 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  44.32 
 
 
732 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  43.59 
 
 
746 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  45.1 
 
 
739 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  42.91 
 
 
739 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  42.91 
 
 
739 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  43.71 
 
 
732 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  43.65 
 
 
732 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  43.65 
 
 
732 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  45.06 
 
 
732 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  43.38 
 
 
732 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  44.93 
 
 
732 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  42.88 
 
 
731 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  44.38 
 
 
732 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  43.72 
 
 
731 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  44.79 
 
 
732 aa  545  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  44.65 
 
 
732 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  44.65 
 
 
732 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  42.28 
 
 
736 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  45.23 
 
 
732 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  41.32 
 
 
774 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  40.26 
 
 
753 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  43.21 
 
 
731 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0275  primosomal protein N'  46.2 
 
 
737 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00025836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  41.38 
 
 
731 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  41.89 
 
 
733 aa  535  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  42.38 
 
 
733 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  40.87 
 
 
730 aa  535  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  42.01 
 
 
732 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  41.73 
 
 
732 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  41.49 
 
 
733 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  39.97 
 
 
743 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  40.35 
 
 
742 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  41.06 
 
 
731 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  43.44 
 
 
740 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  41.05 
 
 
737 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  41 
 
 
731 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  41.26 
 
 
736 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  41.18 
 
 
736 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  40.81 
 
 
736 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  40.57 
 
 
731 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  40.57 
 
 
731 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  40.43 
 
 
731 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  39.59 
 
 
734 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  40.43 
 
 
731 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  43.36 
 
 
745 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  40.85 
 
 
725 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0029  primosomal protein N'  39.61 
 
 
709 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  41.06 
 
 
731 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  42.94 
 
 
720 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  42.94 
 
 
720 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>