191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2653 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  100 
 
 
716 aa  1485    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  44.54 
 
 
729 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  41.96 
 
 
769 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 
758 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  41.02 
 
 
766 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  43.98 
 
 
713 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  39.53 
 
 
717 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  43.79 
 
 
708 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  43.18 
 
 
713 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 
713 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  42.7 
 
 
708 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 
793 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  40.45 
 
 
744 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 
741 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  42.53 
 
 
713 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  42.39 
 
 
713 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  42.15 
 
 
721 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  43.79 
 
 
713 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  43.03 
 
 
713 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  41.14 
 
 
780 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  39.68 
 
 
750 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  39.38 
 
 
772 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 
767 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  39.38 
 
 
714 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 
773 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 
766 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  39.72 
 
 
701 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  36.62 
 
 
775 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
718 aa  170  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
749 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
685 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 
705 aa  131  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
705 aa  127  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  24.11 
 
 
695 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
768 aa  125  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  25.67 
 
 
688 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 
687 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  25.2 
 
 
688 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  25.34 
 
 
688 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  24.65 
 
 
688 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  24.85 
 
 
709 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  24.85 
 
 
698 aa  114  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 
696 aa  114  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  24.32 
 
 
710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  24.32 
 
 
710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  25.07 
 
 
725 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  24.32 
 
 
710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.88 
 
 
710 aa  111  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  24.54 
 
 
713 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
681 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
698 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  24.04 
 
 
710 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  22.91 
 
 
724 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 
702 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 
697 aa  105  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  25.07 
 
 
687 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  25.28 
 
 
719 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.03 
 
 
753 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  22.85 
 
 
749 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  22.88 
 
 
745 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  22.55 
 
 
749 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  22.96 
 
 
667 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  24.22 
 
 
723 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  22.69 
 
 
745 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  22.69 
 
 
745 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  22.69 
 
 
745 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.98 
 
 
676 aa  98.2  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
672 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.83 
 
 
676 aa  95.1  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
702 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 
673 aa  93.2  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.47 
 
 
726 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 
760 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.3 
 
 
699 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 
702 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.15 
 
 
686 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  23.52 
 
 
661 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
689 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  29.81 
 
 
684 aa  77.8  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
668 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 
668 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  23.52 
 
 
681 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  23.36 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  21.65 
 
 
669 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  23.36 
 
 
686 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  29.31 
 
 
691 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 
699 aa  69.7  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  20.63 
 
 
661 aa  67  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.72 
 
 
625 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 
685 aa  63.9  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 
683 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 
702 aa  63.9  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.1 
 
 
689 aa  62  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
613 aa  61.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  25.23 
 
 
668 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  25.23 
 
 
668 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.82 
 
 
750 aa  58.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 
776 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
824 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  22.09 
 
 
714 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>