More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2632 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
296 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  47.9 
 
 
295 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  46.37 
 
 
298 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 
313 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  46.37 
 
 
296 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
294 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  45.33 
 
 
301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.29 
 
 
302 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  45.33 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
299 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 
399 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
305 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
305 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
299 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
294 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
294 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
294 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
299 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
299 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 
293 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
317 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
289 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
302 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 
299 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 
299 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
292 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 
299 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
306 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
305 aa  218  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.41 
 
 
297 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  42.21 
 
 
308 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.96 
 
 
305 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  38.11 
 
 
289 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  40.43 
 
 
290 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  40.61 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  37.06 
 
 
289 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  39.35 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  37.18 
 
 
289 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.63 
 
 
298 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
298 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
306 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
289 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
301 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
297 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
350 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
289 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 
298 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  38.36 
 
 
299 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
304 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
288 aa  208  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
288 aa  208  8e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  37.68 
 
 
289 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000050  transcriptional regulator LysR family  36.95 
 
 
300 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.385466  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
297 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 
298 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1361  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
304 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.260614  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
298 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.68 
 
 
299 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
299 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
304 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
298 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
298 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0677  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
298 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1480  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 
294 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
313 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
298 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.19 
 
 
318 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  39.32 
 
 
302 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
309 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
298 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
306 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
326 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 
301 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
328 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  36.46 
 
 
288 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
314 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
305 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
301 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  36.68 
 
 
328 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
301 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
301 aa  201  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
322 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  36.3 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  35.31 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>