245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2607 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  41.88 
 
 
1067 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  38.91 
 
 
1102 aa  657    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  41.44 
 
 
984 aa  772    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  39.29 
 
 
1010 aa  729    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  42.93 
 
 
965 aa  744    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  54.99 
 
 
1009 aa  1080    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  43.15 
 
 
985 aa  748    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  40.39 
 
 
1063 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  41.81 
 
 
1052 aa  724    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  100 
 
 
1022 aa  2109    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  42.63 
 
 
989 aa  765    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  39.66 
 
 
992 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  52.11 
 
 
1027 aa  979    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  86.51 
 
 
1029 aa  1849    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  38.42 
 
 
1009 aa  720    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  38.19 
 
 
1087 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  41.89 
 
 
1012 aa  796    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  51.97 
 
 
1008 aa  1005    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  47.02 
 
 
1000 aa  915    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  38.26 
 
 
1112 aa  643    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  40.2 
 
 
1060 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  40.62 
 
 
1069 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  55.46 
 
 
1007 aa  1081    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  44.18 
 
 
1035 aa  797    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  39.32 
 
 
1081 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  40.08 
 
 
1004 aa  665    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  43.3 
 
 
1006 aa  724    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  37.92 
 
 
971 aa  668    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  41.14 
 
 
1059 aa  680    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  42.62 
 
 
905 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  38.87 
 
 
1039 aa  627  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  40.61 
 
 
1039 aa  622  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  41.63 
 
 
1033 aa  622  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  39.74 
 
 
1067 aa  619  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  39.43 
 
 
1051 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  37.93 
 
 
991 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  40.74 
 
 
1041 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  38.26 
 
 
1073 aa  592  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  37.73 
 
 
997 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  37.15 
 
 
1078 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  37.19 
 
 
999 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  36.51 
 
 
990 aa  568  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  35.82 
 
 
1079 aa  562  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  35.53 
 
 
1085 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  36.34 
 
 
983 aa  542  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  34.75 
 
 
969 aa  538  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  40.05 
 
 
976 aa  538  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  35.67 
 
 
1011 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  37.65 
 
 
1016 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  35.02 
 
 
1022 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  34.84 
 
 
1023 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  35.72 
 
 
1002 aa  505  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  35.74 
 
 
1031 aa  505  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  38.1 
 
 
1023 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  33.57 
 
 
1142 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  35.41 
 
 
1034 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  30.87 
 
 
1035 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.68 
 
 
1067 aa  130  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.7 
 
 
967 aa  122  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.84 
 
 
967 aa  122  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.53 
 
 
1044 aa  115  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2793  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.94 
 
 
1012 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81193  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.36 
 
 
1032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.23 
 
 
1003 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.88 
 
 
1032 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.22 
 
 
1042 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.08 
 
 
1003 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  23.28 
 
 
1059 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.66 
 
 
986 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.17 
 
 
1074 aa  109  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.31 
 
 
1084 aa  109  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04460  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.94 
 
 
1010 aa  108  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.12 
 
 
1041 aa  108  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0985  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.53 
 
 
1023 aa  108  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.25 
 
 
1031 aa  108  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.37 
 
 
1053 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.13 
 
 
1092 aa  107  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.53 
 
 
1052 aa  107  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.67 
 
 
1044 aa  106  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.51 
 
 
1029 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  26.78 
 
 
1051 aa  105  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  25.37 
 
 
1040 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.86 
 
 
1034 aa  104  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1115  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.32 
 
 
1107 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.55 
 
 
1068 aa  103  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2909  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.75 
 
 
1042 aa  103  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3082  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.42 
 
 
1085 aa  101  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  23.01 
 
 
1033 aa  101  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.67 
 
 
1084 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.77 
 
 
1026 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0608  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.95 
 
 
1006 aa  100  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.96 
 
 
1040 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  24.84 
 
 
984 aa  99.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.93 
 
 
855 aa  99.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0157  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.11 
 
 
1096 aa  99.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3790  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.26 
 
 
1053 aa  99.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  24.65 
 
 
1289 aa  98.2  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24 
 
 
1024 aa  97.8  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1790  restriction enzyme  23.82 
 
 
1072 aa  97.8  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.89 
 
 
1079 aa  98.2  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>