More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2553 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  100 
 
 
421 aa  833    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  56.44 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  47.72 
 
 
438 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  48.97 
 
 
442 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  48.13 
 
 
451 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  44.6 
 
 
418 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  44.36 
 
 
418 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  45.57 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  41.92 
 
 
426 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  41.82 
 
 
471 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  43.95 
 
 
443 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  45.63 
 
 
431 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  47.61 
 
 
444 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  45 
 
 
436 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  38.66 
 
 
428 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  40.21 
 
 
428 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  40.31 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  40.9 
 
 
472 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  46.23 
 
 
441 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  41.3 
 
 
415 aa  269  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  40.31 
 
 
437 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  40.58 
 
 
435 aa  259  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  40.05 
 
 
439 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  40.05 
 
 
439 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  39.65 
 
 
458 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  39.73 
 
 
443 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  40.68 
 
 
452 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  40.68 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  40.68 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  40.68 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  40.68 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  40.68 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  40.68 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  38.74 
 
 
423 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  38.74 
 
 
423 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  38.74 
 
 
394 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  38.74 
 
 
423 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  37.24 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  40.49 
 
 
408 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  40.46 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  39.74 
 
 
417 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  39.31 
 
 
464 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  39.31 
 
 
425 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  34.5 
 
 
438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  30.79 
 
 
424 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  31.34 
 
 
425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  30.85 
 
 
423 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  30.59 
 
 
423 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 
423 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  32.44 
 
 
423 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 
424 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  29.53 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 
423 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
435 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  27.49 
 
 
423 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  30.94 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 
407 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  25.25 
 
 
414 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  25.59 
 
 
422 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  25.24 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  27.58 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  26 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  26.92 
 
 
448 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  28.3 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  30.1 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  26.9 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  28.72 
 
 
428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 
474 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  23.33 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  24.23 
 
 
416 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.76 
 
 
437 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  28.3 
 
 
415 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
432 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
432 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 
427 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
449 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  30.98 
 
 
400 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  28.32 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.74 
 
 
465 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.79 
 
 
432 aa  97.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
432 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  24.34 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.5 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 
523 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 
486 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  24.43 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  28.92 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  27.88 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>