More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2534 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 
468 aa  959    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.46 
 
 
480 aa  359  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.89 
 
 
441 aa  355  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  46.36 
 
 
437 aa  353  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.04 
 
 
497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  40.89 
 
 
484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.45 
 
 
434 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  39.21 
 
 
493 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.75 
 
 
478 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.63 
 
 
450 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.29 
 
 
488 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.24 
 
 
453 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.09 
 
 
512 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  39.78 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.51 
 
 
442 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.75 
 
 
450 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  37.08 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.14 
 
 
498 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.24 
 
 
489 aa  269  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.47 
 
 
446 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.63 
 
 
491 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  33.87 
 
 
462 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.39 
 
 
443 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.15 
 
 
469 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.06 
 
 
405 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.45 
 
 
449 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.01 
 
 
461 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.83 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.33 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  36.36 
 
 
481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  34.24 
 
 
479 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.62 
 
 
447 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  36.13 
 
 
482 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.04 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  34.98 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.4 
 
 
453 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  34.16 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.5 
 
 
436 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.17 
 
 
491 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.18 
 
 
480 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  34.21 
 
 
443 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  32.72 
 
 
438 aa  230  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.7 
 
 
477 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.56 
 
 
494 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  34.15 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  35.11 
 
 
448 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  34.15 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  34.15 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.26 
 
 
477 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  34.3 
 
 
435 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 
478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.26 
 
 
477 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  34.83 
 
 
431 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  35.6 
 
 
454 aa  226  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.64 
 
 
456 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  34.51 
 
 
441 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  32.37 
 
 
455 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  33.03 
 
 
445 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.65 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  32.18 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.88 
 
 
456 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  32.14 
 
 
455 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  31.13 
 
 
449 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.5 
 
 
446 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.55 
 
 
539 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  32.79 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  31.01 
 
 
444 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  32.95 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  32.5 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.33 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  33.25 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  33.25 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.37 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  33.25 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.97 
 
 
874 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.61 
 
 
442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  33.57 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  33.97 
 
 
432 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.29 
 
 
484 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.57 
 
 
465 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.33 
 
 
442 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.82 
 
 
481 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  33.48 
 
 
495 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  33.48 
 
 
495 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.29 
 
 
489 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  33.48 
 
 
493 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  33.48 
 
 
493 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.48 
 
 
493 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.35 
 
 
449 aa  210  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  33.48 
 
 
493 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  33.48 
 
 
493 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  33.48 
 
 
493 aa  210  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  32.64 
 
 
470 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  33.48 
 
 
495 aa  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  32.95 
 
 
432 aa  209  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.77 
 
 
452 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  33.12 
 
 
452 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.77 
 
 
449 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  32.27 
 
 
489 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>