More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2523 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2523  methylation  100 
 
 		 141 aa  295  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  51.82 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.72 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3041  general secretion pathway protein H  41.73 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391226  normal  0.137984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  36.84 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  38.69 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  35.56 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  34.59 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  34.59 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  36.5 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  47.22 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.17 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  35.61 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  34.59 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  61.11 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.2 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  35.56 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.27 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  58.62 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  53.12 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  55.93 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3403  fimbrial biogenesis protein  36.88 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00878868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  30.83 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  42.67 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  55.93 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  50.85 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  53.45 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.76 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.76 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  48.53 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  37.69 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.76 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  53.57 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.76 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  56.36 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  65.31 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  62 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  68.18 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  51.56 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  47.46 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.34 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  39.55 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  32.88 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  41.86 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  40.26 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.81 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  49.18 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  35.77 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  66.67 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  47.89 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  30.6 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  60 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  33.33 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  39.22 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.23 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  66.67 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  38.89 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  30.6 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  53.85 
 
 		 527 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  69.77 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  54.9 
 
 		 567 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  31.88 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  36.17 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  36.17 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  53.85 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.91 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  67.39 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.89 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.81 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  47.89 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  34.07 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.55 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  41.98 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  45.76 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  45.16 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  31.34 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  36.67 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  52.83 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  51.92 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.78 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  58 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  53.85 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  33.8 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  45.33 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  46.97 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  55.77 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  53.57 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.07 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  66.67 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  51.72 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  69.23 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  35.92 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>