More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2371 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
482 aa  970    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.3 
 
 
492 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3362  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.85 
 
 
489 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0212058  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.92 
 
 
471 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.06 
 
 
471 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.25 
 
 
488 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.97 
 
 
488 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.97 
 
 
488 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.72 
 
 
464 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 
509 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  41.77 
 
 
479 aa  348  9e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  40.9 
 
 
498 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.43 
 
 
495 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  40.73 
 
 
499 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.43 
 
 
477 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.13 
 
 
489 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.35 
 
 
485 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.96 
 
 
487 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.76 
 
 
495 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.84 
 
 
496 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.51 
 
 
496 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  40.51 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.51 
 
 
469 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  38.29 
 
 
490 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.71 
 
 
512 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.9 
 
 
497 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.35 
 
 
509 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.11 
 
 
501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.11 
 
 
501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.36 
 
 
514 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.36 
 
 
514 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.44 
 
 
486 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.27 
 
 
520 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38 
 
 
497 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.2 
 
 
516 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  39.57 
 
 
508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.76 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.2 
 
 
509 aa  302  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.72 
 
 
500 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.35 
 
 
486 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.91 
 
 
501 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
497 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.05 
 
 
521 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  39.31 
 
 
488 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  42.86 
 
 
493 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.54 
 
 
503 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570974  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.69 
 
 
499 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.26 
 
 
478 aa  289  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.3 
 
 
537 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.92 
 
 
484 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.92 
 
 
484 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.44 
 
 
523 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.65 
 
 
533 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.26 
 
 
471 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 
498 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.52 
 
 
536 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.27 
 
 
523 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14360  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.97 
 
 
507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0124  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.7 
 
 
525 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.29 
 
 
474 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.74 
 
 
590 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.36 
 
 
516 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.6 
 
 
477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.09 
 
 
486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.63 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0176  outer membrane efflux protein  35.89 
 
 
536 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.63 
 
 
523 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.63 
 
 
523 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  37.23 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.96 
 
 
523 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5123  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.53 
 
 
510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
538 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.35 
 
 
508 aa  266  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.49 
 
 
520 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.57 
 
 
510 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.96 
 
 
539 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.57 
 
 
510 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.49 
 
 
509 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  41.86 
 
 
508 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.32 
 
 
527 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 
513 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.2 
 
 
517 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.12 
 
 
510 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2718  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.21 
 
 
531 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.92 
 
 
493 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0566  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 
521 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  37.92 
 
 
510 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.92 
 
 
510 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  37.92 
 
 
510 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  37.92 
 
 
510 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  37.92 
 
 
510 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.16 
 
 
497 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.71 
 
 
510 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.67 
 
 
502 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>