More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2365 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  746    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  53.87 
 
 
371 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  52.1 
 
 
368 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  49.31 
 
 
378 aa  338  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  44.92 
 
 
383 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  44.71 
 
 
382 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  45.88 
 
 
374 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  45.88 
 
 
374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
374 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  45.05 
 
 
374 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  45.05 
 
 
447 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  47.35 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  46.74 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  46.49 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  43.51 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  45.82 
 
 
374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  45.82 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  43.51 
 
 
375 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  48.77 
 
 
377 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 
355 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  46.15 
 
 
374 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  44.6 
 
 
376 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  47.95 
 
 
377 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  44.74 
 
 
374 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  46.48 
 
 
357 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  47.72 
 
 
376 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  42.86 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0920  hypothetical protein  44.02 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  43.5 
 
 
378 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  43.5 
 
 
378 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0244  protein of unknown function DUF140  44.6 
 
 
372 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0250  hypothetical protein  44.32 
 
 
372 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  34.4 
 
 
383 aa  205  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  32.98 
 
 
372 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.63 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  35.61 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 
376 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  34.32 
 
 
413 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.4 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  35.24 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  31.64 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  35.54 
 
 
376 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  30.67 
 
 
377 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  32.45 
 
 
380 aa  182  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.08 
 
 
384 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.4 
 
 
369 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  34.15 
 
 
406 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.1 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  32.53 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.64 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.42 
 
 
366 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  32.74 
 
 
373 aa  180  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  30.53 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  35.08 
 
 
366 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  40.27 
 
 
374 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.84 
 
 
374 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  32.1 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  33.33 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  33.03 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  31.42 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  32.09 
 
 
388 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  30.56 
 
 
378 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  34.67 
 
 
379 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  30.87 
 
 
384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  28.65 
 
 
396 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  30.61 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  30.96 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  31.66 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  28.37 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  26.76 
 
 
367 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  33.59 
 
 
386 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  31.67 
 
 
382 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  30.58 
 
 
378 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  32.18 
 
 
377 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0180  protein of unknown function DUF140  32.61 
 
 
327 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  30.28 
 
 
378 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  32.05 
 
 
385 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  31.2 
 
 
382 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  29.72 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  31.1 
 
 
344 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  30.62 
 
 
474 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  28.85 
 
 
370 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  30.87 
 
 
370 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 
381 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  31.97 
 
 
383 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  28.42 
 
 
376 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  32.78 
 
 
377 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  29.97 
 
 
371 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  31.28 
 
 
382 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.48 
 
 
376 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  28.94 
 
 
394 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  35.51 
 
 
370 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>