More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2351 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  53.43 
 
 
755 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  53.37 
 
 
741 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  100 
 
 
761 aa  1559    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  41.71 
 
 
763 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 
797 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 
798 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 
783 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 
797 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
767 aa  300  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 
786 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 
757 aa  293  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 
794 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 
778 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 
803 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.73 
 
 
790 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 
778 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 
790 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 
780 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 
800 aa  262  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 
800 aa  262  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 
771 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 
783 aa  248  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
785 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
747 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
704 aa  236  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 
749 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
835 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
769 aa  234  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 
755 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 
726 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
695 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
728 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 
751 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
755 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 
792 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 
732 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
790 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 
761 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 
710 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 
790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.32 
 
 
715 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 
739 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 
729 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 
723 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
720 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 
808 aa  217  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
832 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
745 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 
730 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 
839 aa  214  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 
736 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
728 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
758 aa  211  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
733 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 
750 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
775 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 
838 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
777 aa  207  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
855 aa  207  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
761 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
730 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
848 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
776 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
777 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
731 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26 
 
 
774 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
786 aa  203  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
726 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
722 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  28.97 
 
 
738 aa  203  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
761 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
779 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
788 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
731 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 
776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26 
 
 
763 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 
780 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
763 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  28.63 
 
 
878 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
722 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
762 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
825 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
713 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
743 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
774 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 
815 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
741 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
759 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
809 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
756 aa  195  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
764 aa  194  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
773 aa  194  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
853 aa  194  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
784 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 
864 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
765 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 
759 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>