More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2304 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
317 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.45 
 
 
312 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.45 
 
 
1667 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  40.13 
 
 
335 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39.81 
 
 
1094 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  39.14 
 
 
819 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  39.62 
 
 
354 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.31 
 
 
327 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.87 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.41 
 
 
353 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.13 
 
 
689 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.9 
 
 
354 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.17 
 
 
354 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.58 
 
 
328 aa  185  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  38 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.67 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.23 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  36.69 
 
 
580 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.5 
 
 
328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.93 
 
 
415 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.85 
 
 
328 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.88 
 
 
334 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.2 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.37 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33 
 
 
324 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.22 
 
 
328 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  36.89 
 
 
387 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.05 
 
 
329 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
324 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.45 
 
 
335 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
362 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.77 
 
 
330 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  35.57 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.55 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.64 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.15 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  35.97 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  33.23 
 
 
329 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.5 
 
 
321 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  37.8 
 
 
479 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.99 
 
 
362 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.12 
 
 
752 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.89 
 
 
334 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.38 
 
 
344 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.46 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.72 
 
 
320 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.64 
 
 
366 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.01 
 
 
332 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.92 
 
 
810 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.55 
 
 
323 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.33 
 
 
320 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.4 
 
 
329 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.21 
 
 
327 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.9 
 
 
329 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  31.72 
 
 
312 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.04 
 
 
971 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33 
 
 
1170 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  30.75 
 
 
334 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  31.49 
 
 
314 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.72 
 
 
366 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  35.71 
 
 
556 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.72 
 
 
417 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.17 
 
 
365 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.94 
 
 
607 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
776 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.79 
 
 
457 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  31.15 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.92 
 
 
451 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  31.06 
 
 
325 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.28 
 
 
383 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.65 
 
 
1189 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.6 
 
 
326 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.2 
 
 
328 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.99 
 
 
272 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.2 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.53 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.82 
 
 
348 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  30.19 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.85 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.09 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.05 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  30.95 
 
 
354 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.32 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.19 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  28.28 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.25 
 
 
328 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.65 
 
 
479 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  28.62 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.28 
 
 
310 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  27.88 
 
 
330 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  32.69 
 
 
487 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.09 
 
 
370 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  27.07 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.89 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  29.21 
 
 
329 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  29.21 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  43.45 
 
 
154 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  29.21 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  28.43 
 
 
445 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.15 
 
 
325 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>