42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2298 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  51.38 
 
 
595 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  54.37 
 
 
892 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  30.92 
 
 
407 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  49.53 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  50.91 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  50.94 
 
 
664 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  34.91 
 
 
654 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.36 
 
 
846 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  46.23 
 
 
475 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  39.74 
 
 
546 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  43.97 
 
 
967 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  30.48 
 
 
780 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  45.28 
 
 
695 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  36.84 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  42.31 
 
 
1040 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  48.45 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  43.69 
 
 
539 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  41.9 
 
 
928 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  28.81 
 
 
537 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  28.81 
 
 
537 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  28.81 
 
 
537 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  30.62 
 
 
539 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  40.22 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  42.59 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  41.35 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  33.96 
 
 
617 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  31.43 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  38.83 
 
 
496 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  30.64 
 
 
867 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  38.1 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  33.06 
 
 
708 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  37.5 
 
 
706 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  40.26 
 
 
879 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  37.5 
 
 
705 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  37.5 
 
 
754 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  36.75 
 
 
205 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  30.22 
 
 
699 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  32.77 
 
 
312 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  33.03 
 
 
686 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0210  putative esterase  50 
 
 
475 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>