More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2238 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0435  ABC transporter related  61.34 
 
 
245 aa  294  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  58.26 
 
 
264 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  57.38 
 
 
264 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  59.48 
 
 
269 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0126  ABC transporter component  61 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7658  putative ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
241 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133914  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  56.12 
 
 
270 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3169  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
250 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.386052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3286  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 
250 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.874938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3360  ABC transporter related  40.51 
 
 
250 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1617  ABC transporter related  44.73 
 
 
259 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2783  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 
244 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
251 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.2 
 
 
243 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  39.55 
 
 
248 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  36.69 
 
 
909 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  37.34 
 
 
912 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  32.78 
 
 
243 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  35.92 
 
 
248 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  35.9 
 
 
308 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  36.29 
 
 
943 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.86 
 
 
907 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  38.56 
 
 
322 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  36.48 
 
 
916 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.61 
 
 
313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  38.27 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.02 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  34.89 
 
 
904 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
317 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.4 
 
 
327 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  36.32 
 
 
917 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
356 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.71 
 
 
327 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
317 aa  144  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 
324 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.4 
 
 
339 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 
930 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  36.82 
 
 
593 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  34.75 
 
 
936 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.92 
 
 
317 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.09 
 
 
279 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 
317 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.62 
 
 
308 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  34.01 
 
 
332 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  34.75 
 
 
936 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 
327 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  35.17 
 
 
920 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  34.75 
 
 
906 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.21 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 
327 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  34.96 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  35.62 
 
 
901 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
868 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  34.94 
 
 
932 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  37.95 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  37.89 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  34.96 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.48 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  33.9 
 
 
914 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  32.77 
 
 
922 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.75 
 
 
337 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  33.47 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  35.37 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  35.19 
 
 
901 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  37.83 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  32.77 
 
 
901 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  36.33 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  37.39 
 
 
317 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  33.91 
 
 
235 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.58 
 
 
332 aa  139  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.75 
 
 
312 aa  138  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  33.74 
 
 
307 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  35.15 
 
 
912 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.39 
 
 
295 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  36.33 
 
 
346 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
311 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
321 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  37.61 
 
 
318 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  33.48 
 
 
928 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
315 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  37.61 
 
 
318 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  34.47 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
906 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  35.04 
 
 
906 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  37.61 
 
 
318 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  34.31 
 
 
321 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  34.43 
 
 
320 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2708  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 
329 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  37.87 
 
 
253 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
285 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  35.27 
 
 
255 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  35.19 
 
 
901 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.08 
 
 
306 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>