More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2219 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 
104 aa  208  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  69.9 
 
 
103 aa  151  3e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 
103 aa  150  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  69.9 
 
 
103 aa  150  6e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  68.93 
 
 
103 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  68.93 
 
 
103 aa  147  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 
103 aa  146  1e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 
103 aa  146  1e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 
103 aa  145  1e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  66.99 
 
 
103 aa  145  2e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 
103 aa  145  2e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  66.99 
 
 
103 aa  145  2e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 
103 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 
103 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 
103 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  66.99 
 
 
103 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  67.65 
 
 
103 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 
103 aa  141  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
103 aa  141  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
103 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  65.69 
 
 
103 aa  139  1e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  65.35 
 
 
103 aa  139  1e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  63.73 
 
 
131 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 
103 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 
103 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  133  6e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  133  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  59.41 
 
 
104 aa  130  7e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  60.4 
 
 
103 aa  130  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  129  1e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  64.36 
 
 
102 aa  129  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  127  4e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  60.19 
 
 
103 aa  126  1e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  54.9 
 
 
103 aa  126  1e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  57.28 
 
 
103 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
103 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 
103 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
104 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  121  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
104 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  51.49 
 
 
105 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 
104 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 
104 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 
104 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  120  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.70537e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.20592e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 
104 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  56.86 
 
 
103 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  119  1e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.50093e-10  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  119  1e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  2.30006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
102 aa  119  1e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 
105 aa  119  1e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
104 aa  119  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.68941e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.86548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  119  2e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  118  2e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  118  2e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.3092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.90707e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.45664e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.81262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.28697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.93081e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  117  4e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.65275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  117  4e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.47108e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  117  4e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  117  5e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  117  5e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.50477e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
103 aa  117  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
106 aa  116  8e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  116  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.89228e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  115  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>