More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1989 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 675 aa  1401    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  43.73 
 
 		 675 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  43.52 
 
 		 685 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  39.79 
 
 		 674 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  42.22 
 
 		 657 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  42.34 
 
 		 654 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  41.44 
 
 		 682 aa  488  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  41.83 
 
 		 668 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 683 aa  475  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 667 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  38.85 
 
 		 693 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 744 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 708 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 716 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 656 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 663 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 728 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 690 aa  233  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.76 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 665 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 669 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 651 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.61 
 
 		 666 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.33 
 
 		 666 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.33 
 
 		 666 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.31 
 
 		 666 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.71 
 
 		 666 aa  97.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  20.15 
 
 		 661 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.32 
 
 		 663 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.51 
 
 		 663 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 836 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  21.86 
 
 		 639 aa  89.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 828 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.79 
 
 		 656 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 737 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 815 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 707 aa  87.8  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 749 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 741 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  29.24 
 
 		 707 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 653 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.01 
 
 		 659 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.84 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.84 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.84 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.11 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.7 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 709 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.7 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  22.87 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.7 
 
 		 663 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.52 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.52 
 
 		 650 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.27 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 668 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 638 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  24.07 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.27 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  21.26 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  22.68 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  22.08 
 
 		 676 aa  72.8  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 699 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  27.69 
 
 		 735 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  22.53 
 
 		 617 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  20.77 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  20.77 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  20.77 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1128 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  31.78 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  21.67 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 765 aa  70.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 762 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 642 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  22.65 
 
 		 650 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  20.61 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 651 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.27 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.35 
 
 		 714 aa  68.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  35.2 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>