147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1965 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 413 aa  850    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  40 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  39.01 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  39.36 
 
 		 431 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  39.36 
 
 		 431 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  39.71 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  40.29 
 
 		 449 aa  272  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  36.91 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  36.07 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  36.19 
 
 		 464 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  34.8 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  36.7 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  36.3 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  36.43 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  34.55 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  36.91 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  34.49 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  33.58 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  33.82 
 
 		 411 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  34.64 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  32.6 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  33.83 
 
 		 438 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  46.4 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  32.76 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  30.9 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  32.77 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.58 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  33.33 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.59 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  28.04 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.62 
 
 		 414 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  30.58 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  30.25 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  31.66 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  31.66 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.35 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  31.94 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  28.71 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  32.43 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  28.19 
 
 		 407 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  29.81 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  27.82 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  29.11 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  28.22 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  33.15 
 
 		 448 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  29.09 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  26.7 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  26.7 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  31.22 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  30.62 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  28.4 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  29.32 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  27.89 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  25.94 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  29.55 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  25.44 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.3 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  26.41 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  28.84 
 
 		 487 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  26.17 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  26 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  25.62 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  27.25 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  29.3 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  29.68 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.62 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.54 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  25.4 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  27.17 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.36 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  26.2 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  29.27 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.06 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  26.73 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  24.64 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.7 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  26.74 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  23.57 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.09 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  33.16 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  33.16 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  29.1 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  30.37 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  21.4 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  27.91 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  27.44 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  21.07 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.3 
 
 		 806 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0567  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32 
 
 		 599 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.598217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>