More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1829 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  59 
 
 
203 aa  245  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  54.27 
 
 
201 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  53.77 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  53.77 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  53.77 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  53.77 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  53.77 
 
 
201 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  53.3 
 
 
205 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  53.27 
 
 
201 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  53.27 
 
 
201 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  50.76 
 
 
207 aa  188  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  50.25 
 
 
201 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  49.49 
 
 
197 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  50.76 
 
 
201 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  50.76 
 
 
201 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  50.25 
 
 
201 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  51.27 
 
 
201 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  50.25 
 
 
201 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  48.22 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  40.51 
 
 
200 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  43.32 
 
 
213 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  42.19 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  37.84 
 
 
195 aa  142  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  41.5 
 
 
199 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  36.51 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  39.33 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  40.8 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  41.67 
 
 
195 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  42.13 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  38.34 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  38.34 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  38.34 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  40.84 
 
 
315 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  39.09 
 
 
199 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  39.09 
 
 
199 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  38.58 
 
 
199 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  37.85 
 
 
200 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  36.79 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  36.27 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  37.31 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  39.57 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  36.13 
 
 
194 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  36.63 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.57 
 
 
199 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  43.45 
 
 
151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  36.9 
 
 
199 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  37.84 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  37.57 
 
 
199 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  36.96 
 
 
189 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  37.57 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  35.36 
 
 
321 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  34.01 
 
 
197 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  34.81 
 
 
321 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.3 
 
 
198 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  38.86 
 
 
214 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  35.79 
 
 
189 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  39.64 
 
 
199 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  34.95 
 
 
210 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  36.61 
 
 
195 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  31.66 
 
 
200 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  35.96 
 
 
198 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.21 
 
 
203 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  33.87 
 
 
199 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  38.2 
 
 
233 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.32 
 
 
187 aa  97.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  36.81 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  33.14 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  33.15 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  36.41 
 
 
212 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  31.75 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  39.18 
 
 
209 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  32.46 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  32.74 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  32.58 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  32.74 
 
 
203 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  38.6 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  34.52 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  31.02 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.64 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  27.6 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.93 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  32.4 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.77 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  35.29 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.56 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.13 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.26 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.08 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  32.28 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.72 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.69 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.89 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  31.61 
 
 
174 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.25 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.89 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.37 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.53 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.41 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>